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医院系统的洁净室先用于手术室，也就是我们现在所说的医院手术室净化工程。开始它只是在矫形手术中获得广泛应用，因为矫形手术时间较长，易于引起感染。控制水平较理想的是使用手术台附近的空气洁净度达到100级。一般建议使用顶部高效空气过滤系统，药品检验实验室温湿度，它能覆盖至少3m×3m的面积，从而将手术台和人包括在内。
医疗洁净室获得应用的其它领域有分娩室、保育室、烧伤室、心脏病人护理单元等。新进展之一是牙外科手术洁净室的应用，它降低了在长期手术过程中医务人员被感染的危险。 
主要包括：
1）控制区域。在某些生产、实验过程中，医学实验室净化温湿度，需要对整个房间的温湿度进行控制。但更多的情况是只须对特定的生产、实验区域进行严格控制。
2）基准温湿度。很多生产、实验要求基准温湿度为固定不变的值，例如很多计量实验要求的基准温度为22 ℃，一些纺织类的生产、实验要求基准相对湿度为65%。还有一些特殊的实验过程和气候室，实验室 温湿度监测，要求室内的基准温湿度可以根据实验要求在较大范围内进行调整，此时需要确认其变化范围和变化时间。
3）温湿度精度。温湿度精度一般包括2方面的要求，即单一控制点的时间变化率和均匀度。在参数确认阶段，必须明确精度要求的涵义。均匀度要求一般针对温度精度，东营实验室温湿度，可以用垂直方向和水平方向的温度梯度要求的方式提出。
4）新风要求。新风要求一般根据室内工作人员数量提出。新风对室内环境扰动极大，因此新风量的确定应该尽可能合理、准确。由于一般恒温恒湿环境所需要的换气次数较多，因此不能采用至小新风比的方法确定。
5）可靠性要求。某些实验周期较长或重要的场合，对恒温恒湿环境的可靠性有明确要求，如要求系统可连续不间断运行若干时间。此时需要在设备的备用方面加以考虑。
6）其他。某些电子医药类实验环境对净化级别有严格的要求。有一些实验需要严格控制噪声和振动。还有可能要求室内保持一定正压或负压。
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